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Em X-Men Noir: A Marca de Cain, a história continua do ponto em que o volume anterior parou. A trama de desenvolve no final dos anos 1930. Escondida nos recessos de um templo na selva de Madripoor se encontra a Joia de Cyttorak, desejada por muitas pessoas graças aos seus poderes lendários. Essa mortal "caça ao tesouro" coloca os X-Men, do maligno Charles Xavier, no caminho de um grupo de bandidos liderados por Logan e contra o vigilante conhecido como Anjo. A edição traz ainda a história Arma X Noir.